Al editar (con el editor integrado en miarroba) un código PHP que ya está en el sitio y que funciona bien, al editarlo y modificarlo y darle guardar, aparentemente se guarada pero al darle para cerrar el editor me dice que no se ha guardado. ¿Alguna sugerencia?

Yo te recomendaria que usases FTP para subir o editar los ficheros, mejor todavia si usas FTPS (FTP seguro por SSL)

El editor interno de miarroba se esta quedando obsoleto y no tenemos intención de actualizarlo, es más seguramente sea una herramienta que acabemos quitando, ya que existen miles de soluciones mejores (incluido FTP via WEB completos).