Hola ojala y me ayuden, pues mi problema es el mismo que el del usuiario mundosim.
enseguida lo explico
Tengo activado php  en mi espacio, entonces al bolber a subir el archivo index.php para actualizarlo, no cambia absolutamente nada, asi escriba otro codigo totalmente diferente, con otra estructura color y todo,  al ingresar a mi web no cambia absolutamente nada,
en cambio cuando le cambio la extencion a index.html si sufre las actualizaciones, solo que a mi me sucede con todos los arhivos .php y al cambiarlos a html si cambian.

Nota: al subir algun archivo .php por primera vez, se visualisan prefectamente como lo escrivi, pero al tratar de editarlo desde el editor de mi@ o subir de nuevo el archivo ya actualizado, no sufre los cambios, como explique al ponerlos.html si cambian. Ademas aunque elimine  mi archivo index.php y no tenga ningun index al ingresar a mi web, en vez de desirme que no existe la web o algo asi me manda siempre al antiguo index.php.

¿Has probado a darle a Ctr+F5? ¿O borrar el caché?