Deberias buscar en google... es demasiado amplio lo que preguntas... ademas los pasos pueden variar por ejemplo si instalar w98 o wxp, etc.
Asumo que ya tienes un disco y quieres colocar otro...
A modo de orientacion general te comento esto:

1-Abrir el gabinete, desconectar el disco actual y sacarlo, chequear los jumpers; seguramente esta seteado como Primary Master, debes ponerlo como esclavo (slave), o bien puedes optar por setearlo como Secondary Master. Esto último es válido si es que se encuentra con que el CD ROM está como esclavo del disco rígido. Si es así, te aconsejo que setees el disco viejo como Secondary Master y dejes el cable actual tal como está conectado al IDE. De esta forma vas a necesitar un cable directo desde el disco viejo al IDE secundario.

2-Antes de colocar el disco nuevo, debes setearlo como master (observa el esquema que seguramente hay en la superficie del disco). Colocar el disco nuevo en el lugar libre que tengas.

3-Debes usar un cable que te permita conectar 2 discos rígidos, el extremo es para el master. Atención, controla el sentido de los cables (para guiarte tiene una marca roja sobre uno de los bordes). Observándolo desde atrás, el rojo generalmente va hacia la derecha (chequea que sea así observando los gráficos en la superficie del HD).

4-Coloca el nuevo disco, conecta todo. Presta atención al sentido de los cables de alimentación que entran a las unidades. Solo hay una forma de que se conecten los mismos, pero no está de mas repetirlo.

Te aconsejo que todavía no conectes el disco viejo por las dudas. Enciende la PC e ingresa al setup, elije la opción para autodetectar el disco. Ahora debes configurar también que primero, al encender la PC, lea el disquete (para poder formatear el disco nuevo). Una vez hecho esto, guardar los cambios y salir.

5-Coloca un disquete con sistema operativo (Windows 98 o Windows 95 B conocido como OSR 2). Atención el disquete debe tener por lo menos FDISK.EXE y FORMAT.EXE, además de los archivos necesarios para "bootear".

6-Si todo está bien, el sistema operativo se cargará desde el disquete. Una vez en A: utiliza FDISK y setee el nuevo disco (activa soporte para discos grandes y establece la partición primaria). Sal de este programa y procede a formatear la nueva unidad utilizando FORMAT.

7-Una vez formateado comience a instalar todo el soft (Windows, Office, etc. etc.). Lo mejor es que el disco de inicio te de la compatibilidad para CD ROM y coloques el contenido del disco de instalacion de windows en el disco rigido para que vaya mas rapido.

8-Cuando hayas terminado apaga todo, y conecta recién el HD viejo. Una vez hecho esto, reinicia la PC, entra en el setup y autodetecte las unidades, si hiciste todo bien (BIOS y conexiones de por medio), debería detectar los 2 discos.
Bueno, hecho esto inicia normalmente la PC; Windows va a detectar la nueva unidad. Si tienes CD ROM ahora seguramente este se llamara E:

Si los pasos fueran con Windows XP... te aconsejo que directamente uses XP PRO y bootees directo desde el CD ROM que con el mismo podras particionar y formatear la unidad...

Suerte.-