Pues todos los subforos me aparecen como con mensajes por leer, le das a marcar todo como leido, y a la próxima vez que le das, te vuelve a marcar todos sin leer

A mí me pasaba eso, lo solucioné haciendo clic en cada subforo a Marcar todos los temas como leídos, en vez de Marcar todos los subforos como leídos en la página principal del foro. ¡Espero que esto te sirva!