Mira el código fuente buscando esa instrucción... estara en el archivo: cleanup.php en la línea 27 (+ o -) set_time_limit()
Cita:
set_time_limit
(PHP 3, PHP 4 )
set_time_limit -- limita el tiempo máximo de ejecución
Descripción
void set_time_limit ( int seconds)
Establece el número de segundos que se le permite a un script ejecutarse. Si éste es alcanzado, el script devuelve un error de tipo fatal. El límite por defecto es 30 segundos o, si existe, el valor max_execution_time definido en el fichero de configuración. Si seconds (segundos) se establece a cero, no se impone ningún límite.
Cuando se llama, set_time_limit() reinicia el contador del timeout a cero. En otras palabras, si el timeout es el de por defecto de 30 segundos, y después de 25 segundos de ejecución del script se realiza una llamada set_time_limit(20), el script se ejecutará durante un total de 45 segundos antes de alcanzar su límite.
Advierta que set_time_limit() no tiene efecto cuando PHP se ejecuta en modo seguro (safe mode). No hay otra opción que que desactivar el modo seguro o cambiar el límite de tiempo en el fichero de configuración.
Por lo que leo en este texto simplemente extablece durante cuanto tiempo se puede ejecutar... pero como ponen en el ejemplo se puede hacer uso malintencionado del mismo, por eso no se puede activar.
No se para que lo usa, tendrías que verlo, pero quizás pudieras quitar esa línea... o comentarla, para no perderla y ver si sigue funcionado.
De todas formas, lo mejor es preguntar los que han hecho el invento.
Para comentar una línea se pone "//" al inicio de la misma, de esta manera pasara a ser un comentario.