He estado comprobándolo varias veces, y siempre me sucede lo mismo sin excepción.
Cuando borro algún archivo de cualquier directorio de mi web, si a continuación quiero subir algún archivo en el mismo directorio, el webftp provoca un error de esos que aparece el mensaje "se ha provocado un error, suele pasar cuando se intenta hacer algo que no está permitido... blablabla..."
Vamos, que la página de webFTP que se carga tras borrar algún archivo incorpora algún error cojonero que impide acto seguido enviar un archivo ahí mismo.
Además, para mayor pitorreo, si pulso en el enlace de retroceder al directorio superior; muchas veces me envía a una página completamente en blanco de la que no hay forma de salir excepto volviendo atrás (y entonces hay que darle a recargar, porque la página anterior ha caducado). Si bien esto no me lo ha hecho siempre; sinó que iba a ratos (a ratos siempre me lo hacía, y al cabo de unas horas no sucedía ninguna vez).
Al final lo único útil que podía hacer era volver a la página inicial del WebFTP (directamente desde la barra de direcciones) y vuelta a ir hasta el directorio en el que tuviese que hacer algo. Es decir, los archivos los podía terminar subiendo, borrando o renombrando perfectamente; pero tenía que dar más vueltas que el Tebeo.
A ver si os podéis mirar qué gaitas le sucede al WebFTP.
Un saludo.