Necesito realizar un Backup he intentado desde phpmyadmin pero la BD esta muy pesada y se demora mucho y al final no lo realiza... hay alguna otra forma de realizar backup, el sitio lo estoy manejando con php-nuke pero tampoco me funciona el backup desde aqui.

Lo suyo es desde el phpadmin... podrías, hacerlo primero de unas tablas, después de otras...